Zdaniem krakowskich władz Jerzy Buzek szczególnie zasłużył się dla miasta będąc orędownikiem rozbudowy infrastruktury badawczej i lokalowej Uniwersytetu Jagiellońskiego. Jak informuje krakowski ratusz z zapałem i zaangażowaniem włączył się on w realizację idei budowy III Kampusu UJ. Jego rząd przyjął Program Wieloletni „Budowa Kampusu 600–lecia odnowienia Uniwersytetu Jagiellońskiego”. Była to największa inwestycja w obiekty publiczne w historii Krakowa i Małopolski, przekraczająca w sumie 1 miliard zł.
Jerzy Buzek jest też od lat zwolennikiem rozwoju współpracy Małopolski i Śląska, promując opracowanie i wdrożenie Strategii dla Polski Południowej.